雜交捕獲是一種靶向目標(biāo)富集方法，該方法通過針對目標(biāo)基因設(shè)計(jì)捕獲探針，捕獲富集出高價值的目標(biāo)基因序列進(jìn)行測序，提高目標(biāo)區(qū)域的測序深度。通過生物信息學(xué)分析，得到目標(biāo)基因的變異信息，廣泛應(yīng)用于遺傳病篩查和腫瘤檢測等領(lǐng)域。
百力格工業(yè)化合成平臺可以生產(chǎn)用于解決高通量測序、靶向測序等需求的高質(zhì)量捕獲探針，也可以根據(jù)客戶需求提供定制化設(shè)計(jì)服務(wù)，捕獲效率更高。
捕獲探針panel設(shè)計(jì)
1. 質(zhì)量驗(yàn)證（腫瘤5基因KRAS、ALK、ROS1、EGFR、BRAF，與競品對照）
數(shù)量：Baits數(shù)量相差不大，主要是對困難區(qū)域
覆蓋度：BLG 覆蓋度：99.9%；競品覆蓋度：99.0%
質(zhì)量：GC 分布相較于競品更集中；mask 指數(shù)分布相當(dāng)
2. 設(shè)計(jì)策略與結(jié)果輸出
探針一般參數(shù)過濾：
gc、mask、Tm等
Blast映射過濾：
使用Blast 工具將所有baits 回貼至基因組，并且將比對結(jié)果進(jìn)行歸類，根據(jù)回貼至基因組比對到的個數(shù)將探針分為green，yellow，black
設(shè)計(jì)策略：
1. 高特異性：只保留特意性高的green探針，去掉yellow和black探針（建議選擇）
2. 均衡特異性與覆蓋度：保留特意性高的green探針和特異性中等的yellow探針，去掉特異性差的black探針
panel調(diào)整策略：
某些區(qū)域的覆蓋度相對較低：增加該區(qū)域的探針含量/針對這部分區(qū)域額外設(shè)計(jì)探針加到原panel
3. 實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
raw data | Capture efficiency | Mean depth | dup% | Chimeras rate | fold_80 | 0.20*mean | 1X | 10X | 100X | |
腫瘤5基因-競品I設(shè)計(jì) | 1.157 | 62.44% | 6275.15 | 36.47% | 2.55% | 1.31 | 98.11% | 99.70% | 99.34% | 99.07% |
腫瘤5基因-BLG v2設(shè)計(jì) | 1.157 | 70.33% | 7205.494 | 33.99% | 2.39% | 1.24 | 98.26% | 100.00% | 99.82% | 99.13% |
腫瘤5基因：KRAS、ALK、ROS1、EGFR、BRAF（CDS區(qū)）
服務(wù)優(yōu)勢
1. 高效率：采用高通量合成平臺結(jié)合自動化純化分裝，確?？焖俳桓?；
2. 保密性：信息管理系統(tǒng)保證對客戶序列信息的保密；
3. 定制化：根據(jù)客戶研究需求自由組合靶向基因，支持多樣本混合捕獲；
4. 精確合成：超過99.6%的化學(xué)耦合率，低頻突變并且每條探針都經(jīng)過100%質(zhì)譜檢測。
（常規(guī)合成堿基錯誤率在1/1，000左右，特殊合成可以提升到1/100，000以下的錯誤率。）
服務(wù)詳情
服務(wù) | 堿基長度 | 規(guī)格 | 純化方式 | 交付標(biāo)準(zhǔn) |
捕獲探針 | 80-120 nt | 500 pmol 定制 | 定制 | 單管/96孔板 干粉/液體 |
*捕獲探針產(chǎn)品按條收費(fèi)
