捕獲探針設計
設計流程

設計優勢
1. 多種識別方式:bed格式文件,Fasta 文件格式,GeneSymbol等;
2. 優化的算法:綜合考慮了探針的GC 平衡、特異性、探針之間的二聚體、發卡結構等。使用更細的顆粒度尋找最佳探針方案,同時確保使用更少的探針達到覆蓋度最大化,減少成本;
3. 靈活的參數選擇:可選擇1x,2xtiling和overiap等不同的密度模式和不同的參考基因組或者目標序列,不僅限于常見模式生物或者人類基因組:根據序列特異性,極端GC以及結構區域對探針風險進行分級等;
4. 多種設計方案:不同區間采用不同的方案,例如:基因區間和間區、SNP骨架、MSI采用不同的優化算法進行設計;
5. 可持續性:通過spike-in 的方式,可以在原有的panel中另外添加探針形成新的panel;
6. 使用靈活、門檻低:smartbaits采用SOL關系型數據庫后端,以最小化需要高內存負載和大量V0計算時間的數據文件問題。用戶可以快速使用多個不同的篩選標準重新分析,并最小化使用門檻。
設計報告

捕獲探針設計工具鏈接:
性能測試
1. 百力格SmartBaits設計工具,設計的panel性能優于競品Ixx設計工具;
2. 競品Ixx設計的panel基礎上,用SmartBaits專用算法對未覆蓋的高度重復困難區域設計探針spike-in,提升覆蓋度&捕獲效率。

服務流程

服務特點





